Arthrosporen (Gliedersporen) sind typisch für die Hefegattung Trichosporon und die Schimmelpilzgattung Geotrichum. Trichosporon hat Sproßzellen (meist in Haufen) und Arthrosporen, die aus den Myzelfäden entstehen; Geotrichum dagegen hat niemals Sproßzellen, sondern nur Arthrosporen, die aber mit Sproßzellen verwechselt werden können, wenn sie einzeln oder in Haufen liegen. Abgebildet ist Geotrichum candidum, der „Milchschimmel“.
Sexualsporen, z.B. Askosporen, sind typisch für „perfekte“ Hefen, d.h., für Hefen, die sexuell aktiv sind, z.B. für Saccharomyces cerevisiae, die Bierhefe, die im Vaginalsekret vorkommen kann, wenn Spülungen mit hefehaltigen Flüssigkeiten vorgenommen werden. Die Abbildung zeigt Askosporen von Saccharomyces cerevisiae auf Reisextrakt-Agar.
Die weitere Differenzierung der Hefen erfolgt mit Hilfe biochemischer Reaktionen, und zwar durch Prüfung der Gärungseigenschaften und der Assimilationsfähigkeiten. Einige weitere Tests sind von Fall zu Fall erforderlich, z.B. Ureasetest, Fettspaltung u.a. Diese Untersuchungen sind Speziallaboratorien vorbehalten.